肥胖相关基因与胃癌发病的遗传易感性分析

  • 摘要: 【目的】探究肥胖相关生物学通路关键基因遗传变异及基因-肥胖交互作用对胃癌发病的影响,以更加深入了解胃癌的发病机制,帮助识别胃癌高危人群进行个体化预防。【方法】本研究基于上海郊区成人队列(SSACB)的胃癌病例开展病例对照研究,共纳入267例胃癌病例和267例按年龄、性别采用倾向性评分以1:1匹配的健康对照。经过全基因组基因分型、质量控制、插补后,四条肥胖相关生物学通路上的115个基因的19 250个单核苷酸多态性位点(SNPs)纳入分析。通过单因素和多因素logistic回归评估SNPs与胃癌发病风险的关联,采用假阳性报告概率(FPRP)进行多重检验校正。利用日本生物银行(BBJ)和芬兰生物银行(FinnGen)对SNPs进行验证。对于通过验证的位点,进行表达数量性状位点(eQTL)和基因差异表达分析。采用相加和相乘2个尺度,评估基因-肥胖交互作用对胃癌发病的影响,采用相对超额风险度(RERI)、交互作用归因比(AP)和协同指数(SI)评估相加交互作用,ORGxE和Pinter评估相乘交互作用。结果:41个SNP位点与胃癌发病显著相关(Padj<0.05, FPRP<0.1),包括7组单倍型块。其中ACACB/rs2268401(SSACB:P=0.005,BBJ:P=0.049)、HRAS/rs12785860(SSACB: P<0.001, FinnGen: P=0.045)、PTPN1/rs6095985(SSACB: P<0.001, FinnGen: P=0.023)遗传变异经过人群验证与胃癌发病风险显著相关。HRAS/rs12785860 G等位基因与HRAS基因的mRNA表达水平下调相关(P<0.001),且HRAS在胃癌组织中比癌旁组织的表达水平更高(P<0.001)。JAK1/rs11208559与腰围(WC)存在正向相加交互作用RERI=2.29(0.06~4.53),AP=0.57(0.23~0.9),S=4.03(2.2~5.87)。结论:肥胖相关生物学通路SNPs及单倍型与胃癌发病风险相关,提示肥胖通路遗传变异对胃癌产生影响。HRAS/rs12785860影响HRAS基因表达,可能是是胃癌发病的潜在分子标志物。JAK1/rs11208559与肥胖在胃癌中存在交互作用,携带GC/CC基因型且中心性肥胖的人群患胃癌的风险增加,为胃癌的个体化预防提供线索和依据。

     

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